一、临床心理学的指导思想
临床心理学总的指导思想是：既要注意到人类内在的精神-生物学因素，如神经系统的结构和功能，人体生理过程与精神活动的交互影响等；又要注意到人的一切功能所赖以实现的外在自然环境和社会环境。在临床心理学范围内考虑各种问题时，无论这些问题表现在一个个体，还是某一群体，都应从上述两方面入手，从人的内外两方面的相互关系中去寻找答案和解决办法。
二、临床心理学与宗教
临床心理学在具体的诊断、治疗和咨询服务方面与宗教活动的根本区别，已包含在科学与宗教的根本对立之中。虽然人们有时借助于宗教和迷信，也能一时地或较长久地解决精神上的苦恼和困难，但这与临床心理学毫不相干。瑞士心理学家荣格认为，人类具有宗教心灵功能。人们从内心希望寻找一种宗教，愿意接受这种宗教对自己的影响。所以，当宗教引入笃信者的精神世界之后，可以排遣他们的痛苦。但是，宗教活动在处理人的行为时，从一开始就是以独裁、武断为依据的，它们不具有丝毫理性的思辨和实验的根据。而科学认为宇宙中的一切都遵循着自然规律，而自然规律不是自明的，必须通过细心观察思考和实验研究才能获得通晓这些规律的必要资料，而后进行概括以便作为判断这一类事物的依据。临床心理学正是遵循着一般科学的法则来处理人的精神与行为问题的，每一个决策都必须根据事实规律或者说按照严格的科学规定做出，不能只凭个人经验或利用患者对心理学的盲目信任做出指导。
三、诊断与治疗并重
临床心理学另一原则是诊断与治疗并重。很多人往往以为临床心理学只是一系列测验和检查工作。其实，临床心理学不是以测定和诊断为最后目的，它的最终目的是通过各种治疗手段，使心理学的原则在具体个人见到实效。实际上，就连某些诊断的可靠性，也是在逐步治疗过程中渐渐明确并被证实的。
由于治疗是临床心理学中的关键性的实践领域，所以任何人从事这类工作必须十分谨慎。一般没有经过训练和没有经过考核的人，无论是心理学家或是医学工作者，都无权做出治疗方案，这恰似医疗工作中的处方权一样。