在应用干扰素治疗乙肝时，需要注意两个方面的问题：
(1)剂量；多年以前刚开始使用干扰素时，剂量一般都比较小，每次100万单位。虽然病人副反应比较轻，但疗效却不好。以后多年来，国内外的常规剂量是300万单位／次，隔日一次，疗效较前有了明显的提高。近年来开始有人应用更大剂量的干扰素， 如500万～1000万单位，疗效较以前又有所提高。 目前认为，在1000万单位的范围内，提高剂量可以 提高疗效，但副反应也随之增加。当单次剂量超过 1000万单位时，副反应过大，病人不容易耐受，而且疗效也未见进一步提高。亚洲人种由于体型较小，也不适合用更大剂量。所以现在比较流行的观点是 500－600万单位／次，隔日一次，比较合适。也有人 主张最初1～2周可以每日—次，然后再改为隔日一 次，疗效可能会更好。当然，如果因为经济问题，或 因副反应问题而不能耐受更大剂量的干扰素那么每次 300万单位的剂量也是可以的。或者先用100万单位的剂量诱导耐受，然后逐渐增加剂量到常规量。总之，干扰素的剂量要个体化，因人而异，以能够平安 耐受为准。如果不能耐受干扰素的副作用，那么就谈不上疗效的问题了。
(2)疗程；最初干扰素治疗的疗程多为三个月，但大量的疗程观察表明，三个月的疗程为时太短，很多病人还未来得及显出疗效便已停药。在干扰素治疗乙肝时，早期常常表现为转氨酶升高，此为干扰素的“治疗反应”。待干扰素的疗效出：现后，转氨酶开始下降一伴以上。所以现在要求随着病毒复制指标的阴转。这整个过程往往需要半年的干扰素疗程最好在6个月或以上，能到10～12个月更好。过去在治疗三个月时常常做化验看看转氨酶和病毒指标的情况，如病毒复制指标没有阴转，转氨酶仍然升高，则判定为干扰素无效，停止用药。现在认为以三个月为限，判定疗效时间太短，很多病人只要坚持用下去还会奏效的。提前放弃治疗对病人不利。所以现在的观点是只要病人能够耐受干扰素的副作用，只要肝功能未出现明显恶化，就可以将疗程再延长下去，可达一年以上。个别成功的病例甚至在用药的两年后才出现长期稳定的疗效。对疗效的观察目前提倡治疗前后的两次肝活检，因为观察肝细胞坏死是否减轻，肝纤维化是否减轻，比之观察转氨酶是否下降，病毒复制指标是否阴转更具有实际意义。肝纤维化的进展才是肝病进展的核心，而转氨酶和病毒指标只是——些表面的东西。阻断了肝硬化，阻断了肝癌的发生，就是我们目前所能得到的最好结果了。
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