目前对脂肪肝的治疗仍以去除病因为主，在调整饮食的同时，可选择适当的保肝、降脂药物，并辅以对症治疗。早期诊断、早期治疗能有效地控制脂肪肝的进一步发展，并可使脂肪肝逆转。目前脂肪肝的治疗方法主要包括如下几点：
(1)去除病因，治疗原发病：去除病因，控制原发病对脂肪肝的防治至关重要。 尤须注意易被忽视的病因，如药物副作用、毒物中毒、肉碱缺乏状态、甲状腺功能亢进或减退、肝豆状核变性(Wilson病)、重症贫血及心肺功能不全的慢性缺氧状态等。
(2)调整饮食，纠正营养失衡：调整饮食是脂肪肝治疗的重要环节。原则上应摄入新鲜蔬菜、瘦肉(以牛肉、羊肉为主)和富含亲脂性物质的膳食，以使体重接近正常。需要注意的是，脂肪肝病人的饮食中仍要含适量的脂肪，并注意控制糖类的摄入。因为摄入不含脂肪食物时，机体仍可从糖类及氨基酸前身物质合成脂肪，而摄入过多的糖类(特别是甜食)又可增加胰岛素分泌，促使糖转化为脂肪。此外还应根据不同病因、不同病情确定饮食构成。
(3)增加运动：纠正不良行为及自我保健意识的教育，以维持理想体重及相对正常的血脂和血糖水平。运动治疗对于肥胖病、糖尿病、高脂血症等所致脂肪肝的消退尤为重要。
(4)药物治疗：以促进肝内脂肪消退，防止肝细胞坏死、炎症及肝纤维化。胆碱、蛋氨酸及维生素B族和一些血脂调整药常被用来治疗脂肪肝，但大多疗效尚不确切，副作用较大， 如应用不当反可加剧肝内脂肪沉积，甚至导致病人肝功能不全或恶化，故脂肪肝的治疗重在去除病因、控制饮食、增加运动、降低体重，药物治疗仅起辅助作用，切勿本末倒置。
(5)中医中药，辨证施治：许多中药如丹参、川芎、决明子、山楂、泽泻等对于脂肪肝有效，可按照中医辨证施治的原则组方，以减轻症状。但应注意中药治疗脂肪肝并非十分有效，且长期服用中药也有毒副作用。
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