饮食禁忌对临床治疗也十分重要，服药期间往往由于治疗的需要，要求病员忌食某些食物。一般凡属生冷粘腻、腥臭等不易消化的食物，均应避免食用。
当疾病初愈，胃气未复，不宜进食肥甘之品，更不能骤然暴食，而宜以软食调养。《内经》载 “病热少愈，食肉则遗，此其禁也。”
妊娠、产后，因孕育胎儿或哺乳等特殊生理情况，如妊娠期因脏腑经络之血，皆注于冲任以养胎，应避免酒、干姜、胡椒、辣椒、狗肉等辛温燥火之食物，以免伤阴耗液而影响胎孕；妊娠后期，由于胎儿逐渐长大，易成气滞，故应少食胀气及收涩食物，如蕃薯、土豆等。产后多虚多瘀，同时还需化乳养育婴儿，故宜食易消化及营养丰富之蛋白饮食。
此外，应注意食物与药物、食物与食物之间的禁忌。如猪肉反乌梅、桔梗、黄连、苍术、百合 ；猪血禁地黄、何首乌；猪心忌吴萸。羊肉反半夏、菖蒲；狗肉反商陆、杏仁、蒜；鳖肉忌芥子、薄荷；鲫鱼反厚朴、麦冬；鲤鱼忌砂仁；雀肉忌白术、李子、白木耳；生姜反蜂蜜，猪肺与花菜同食，令人气滞；鲤鱼忌狗肉；龟肉不可合酒果及苋菜同食；鳝鱼忌猪肉、狗血；鸡肉忌胡蒜、李子、鲤鱼、兔肉；鲫鱼忌砂糖、猪肉；牛肉不可与猪肉同食；鸭蛋忌与鳖肉、李子、桑椹同食；雀肉不可与猪肝同食。
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