多普勒的探头主要是放在能穿越的颅骨较薄处和自然孔道，以了解颅内血管的血流情况。由于探头所放的位置不同，可探到不同的血管血流信号。如将探头放在颞部太阳穴处(颞窗)，可得到大脑中动脉、大脑前动脉、大脑后动脉的血流信号；探头放于枕后叶中线位置(枕窗) ，可得到椎动脉和基底动脉的血流信号；探头放在闭合的眼睑上(眼窗)，可得到眼动脉和颈内动脉颅内段的血流信号。
TCD临床应用，近年来日趋广泛。它对检测颅内动脉重度狭窄或闭塞引起的缺血性脑血管病，蛛网膜下腔出血所致的脑血管痉挛，动静脉畸形，脑动脉硬化，脑供血不足以及动脉瘤、颈动脉—海绵窦瘘等，有较高的诊断价值，起到了头颅CT、核磁共振所起不到的作用，所以，TCD已成为检查脑血管病的一种新武器。
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