(1)颈椎间盘突出：目前，MRI成像技术是对椎间盘病变进行检查的最有效的方法。因为MRI成像对组织密度的分辨率高。无需作其他的创伤性检查，即能分辨正常纤维环与髓核。并显示椎间盘突出的方向与程度，了解椎间盘有无变性。在这方面其优于CT。
(2)观察颈椎后纵韧带钙化症：MRI成像可以直接显示骨刺及后纵韧带钙化的脊髓压迫情况，且显示颈胸段移行部位的脊髓压迫更明显。
(3)排除脊髓肿瘤及脊椎肿瘤：首先它能明确肿瘤的部位、范围及其与神经轴的关系。再者是能明显显示肿瘤的形态与组织结构特点，而有助于判断肿瘤的性质。对于脊椎肿瘤可以了解肿瘤的范围及对脊髓压迫的情况。
(4)明确颈椎外伤和感染的病变程度：目前，MRI成像是唯一能够显示脊髓形态的影象学检查方法，它能清楚地显示脊髓损伤的部位、出血、水肿、变性、坏死等情况，还能显示陈旧性脊髓损伤的继发性病理改变，如脊髓萎缩、空洞形成、胶质增生及纤维组织增生。对早期诊断、判断预后及指导治疗有很大的帮助。同样，MRI也是诊断椎体、椎间隙感染最有效、最特异的检查方法。
(5)明确先天性畸形的疾病诊断：MRI检查对Arnold-Chiari畸形很有诊断意义。可在矢状面图象上显示小脑扁桃体的下降状态、范围，第四脑室的位置，脑干、颈髓、上颈椎管连接和枕骨大孔的关系，可以判断Chiaris畸形的类型及范围。对脊髓空洞症的诊断，MRI成像无需进行侵袭性的检查，即可清楚显示病变的范围。对脊椎椎管融合异常，MRI检查可清楚显示脊髓的状态，脂肪瘤的范围及脊椎与皮下组织、皮肤等周围组织的关系。
(6)排除动静脉的畸形：MRI成像对髓内型动静脉畸形的诊断有相当的价值，比血管造影及CT效果更佳。
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