乳腺纤维腺瘤是否会恶变，是许多患者最关心的问题，也是临床医生所关心的问题，因为这直接关系着疾病的预后与临床对策。一般认为，乳腺纤维腺瘤发生恶变的几率很低，仅有约 0.2%的病例会发生恶变。恶变常易于妊娠哺乳期发生，或于年龄较大、病史较长的病例发生。
乳腺纤维腺瘤的恶变以发生肉瘤变者为多，而发生癌变者较少见。多数学者认为，乳腺癌的发生与乳腺纤维腺瘤无关；亦有学者认为当乳腺增生病患者同时再患有纤维腺瘤时，则增加了患癌的危险性；还有学者指出，绝经后的女性发生纤维腺瘤，则癌变倾向增加。
因此，一般来讲，如果患了乳腺纤维腺瘤，不必过于紧张，特别是20岁左右的年轻女性，更是没有必要为纤维腺瘤而苦恼，只需在临床医生的监控下进行观察，如果医生认为必要，可服药治疗一段时间；如果发现近期腺瘤持续长大，则可择期手术；如果准备妊娠，亦可考虑在妊娠之前将其手术切除。
尽管乳腺纤维腺瘤中仅有极少的恶变比例，但临床处理时，还是应提高警惕，特别是对于那些发病年龄在35岁以上，且肿块在2cm以上者，原则上应予手术切除。
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