临床检查与病理检查之间经常存在着一定程度的假阴性或假阳性率，由于病理分期是在对手术后病理标本做直观检查后作出的诊断，更加真实客观地反映了乳腺癌的严重程度和侵犯范围，因而病理分期比临床分期更为正确。TNM分期根据病理检查做分类，称为PTNM分期。具体如下：
(1)PT：原发肿瘤病灶，与TNM分期相同。
(2)PN：区域淋巴结。
PNx：无法对区域淋巴结状况作出评价(如以前已经切除或没有切除淋巴结供病理检查)。
PN0：组织检查无区域淋巴结转移。
PN1：同侧腋窝淋巴结转移，但尚未融合。
PN1a：淋巴结内仅能够在切片上可见转移灶。
PN1b：肉眼可见转移灶。
又分为①微小转移灶，直径<0.2cm；②1～3个淋巴结转移，直径>0.2cm；③4～6个淋巴结转移，直径>0.2cm；④转移灶超过淋巴结包膜；⑤转移灶超过2cm。
PN2～3：分期同TNM分期。
(3)PM：远处转移，分期同TNM。
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