(1)西医治疗 主要是以抗生素治疗为主，常用的抗生素有青霉素、四环素、氟哌酸、灭滴灵等。如患者是由于淋病引起的精阜炎，菌必治、淋必治是首选的药物；如患者是由于感染支原体或衣原体引起的精阜炎，阿奇霉素、美满霉素是首选的药物。治疗的周期一般需要10～20天。
(2)中医治疗 常用辨证施治的方法治疗。主要的证型为湿热瘀阻证和肾阳不足证。湿热瘀阻证常见于疾病的早期，患者有明显的射精疼痛，阴部瘙痒或阴部潮湿感。常用治疗方法为清热除湿。常用药物为萆分清饮加减：
黄柏10g 泽泻10g 木通10g 瞿麦10g 琥珀5g 丹参30g 泽兰10g 鱼腥草30g 冬葵子30g
肾阳不足证常见于精阜炎的后期。患者多伴有阳痿、早泄、腰膝酸软等症状。治疗宜温补肾阳。常用方药为八味地黄丸加减：
附子10g 肉桂10g 蛇床子20g 生熟地各10g 山萸肉10g 山药30g 女贞子20g 枸杞子1 0g 泽泻10g 丹皮10g 当归10g 何首乌10g 金樱子10g 杜仲10g 鱼腥草30g
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