由男性病人尿道取材时，一般用接种环或小棉拭子伸入尿道2～4mm，转动后取出分泌物，有时略带少许粘膜，故患者感觉疼痛，但较轻微，为一过性疼痛；从女病人取材时，需先用阴道窥器暴露宫颈口，用棉拭子揩去宫颈口的脓性分泌物后，再用第二个棉拭子插入宫颈管1cm，转动并停留10～20秒钟，让棉拭子充分吸附分泌物，患者也有轻微的不适感。
将采集的标本立即接种于培养基中。国外常用的培养基有Thayer-Martin培养基、New York City培养基和Martin-Lewis培养基。国内正在研制国产化的培养基，具体培养方法为使用5% ～10%二氧化碳环境(烛缸)，培养温度为36℃，相对湿度80%以上，培养24～48小时观看结果。
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