口舌生疮是在临床上很多见的口腔病损，它不但见于复发性口疮，也可见于白塞病、创伤性溃疡、结核、恶性肿瘤、克隆病、疱疹性口炎等。但以复发性口疮最为多见。复发性口疮人们常称之为口疮，有广义和狭义之分。一般来说，阿弗他溃疡是指疼痛而原因不明的溃疡，习惯上称为口疮，以反复发作的复发性口疮较多见，此为狭义的口疮；而所有口腔内的溃疡性病变，如白塞病、创伤性溃疡等也统称为口疮，属广义的口疮。
重型复发性口疮与结核性溃疡、恶性肿瘤在口腔内的表现有许多相似之处，三者均有深在的溃疡，病程长，溃疡久不愈合，此时应加以鉴别。结核性溃疡也多发于中、青年人，溃疡深在，周围组织正常或有轻度浸润，中央呈肉芽状，无反复发作史及自限性，患者全身可有结核体征(如肺结核)，取活组织检查可证实为郎罕细胞。恶性肿瘤多发于老年人，溃疡可深在或浅在，向周围浸润广而硬，中央底部呈菜花状，无反复发作史，病变生长较快，患者全身状况差，体质弱或呈恶病质，取活组织检查可证实为癌变。
轻型复发性口疮因与疱疹性口炎同有小而散在的浅表溃疡，二者较难鉴别。疱疹性口炎多发生于儿童(复发性疱疹性口炎则可见于成年人)，可发生于口腔任何部位，但极少发生于牙龈，粘膜上有大面积的充血区，溃疡多而小，有的仅针尖大，融合成多环状、大的溃疡，疼痛重，唾液多。
白塞病患者有口腔内粘膜溃疡，多为轻型且反复发作，与复发性口疮相似。除此之外，白塞病患者还有眼、生殖器部位及皮肤等处的病损同时或相继或单独出现，以虹膜睫状体炎、外阴溃疡多见。在注射针眼处或针刺皮肤处，可见非特异性炎症反应，即过敏反应实验阳性。
克隆病是消化道的一种慢性特异性肉芽性疾病，又名局限性肠炎、肉芽肿性肠炎。在唇、颊、腭、咽等处发生溃疡、小结节，牙龈、牙槽嵴上为增生、发红或肉芽肿样颗粒状。以腹部症状为主，腹痛以右下腹明显，腹泻，便血，午后低热，乏力，体重减轻，晚期可出现肠梗阻、肠穿孔等。
创伤性溃疡有明显的局部刺激因素，溃疡位于创伤的相应部位，大小形态不一，去除刺激后溃疡即可愈合，不会再次发作。
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