肺癌组织中EB病毒致癌相关基因BNLF1检测意义初探
中国肿瘤临床 2000年第1期第27卷 论著选登
作者:彭晓帆 银平章 孔令非 徐继跃 刘政国 王宝梅 赵跃武
单位:彭晓帆(河南省人民医院病理科 郑州市450003);银平章(河南省人民医院病理科 郑州市450003);孔令非(河南省人民医院病理科 郑州市450003);徐继跃(河南省人民医院病理科 郑州市450003);刘政国(河南省人民医院病理科 郑州市450003);王宝梅(河南省人民医院病理科 郑州市450003);赵跃武(河南省人民医院病理科 郑州市450003)
许多研究表明Epstein-barr病毒(EBV)感染与鼻咽癌、非洲Buikitt淋巴瘤、霍奇金病 等恶性肿瘤的发生密切相关。近年来,国内外对EBV与肺癌相关性研究渐多,但仍无定论。 笔者采用独立设计引物的PCR方法、限制性酶切分析法等检测肺癌中EBV-BNLF1基因,从基 因水平上对EBV与肺癌关系进行初步探讨。
1 材料与方法
1.1 标本来源
收集河南省人民医院和河南省胸科医院40例肺癌手术切除标本。经病理诊断鳞癌26例, 其中高分化2例,中分化12例,低分化12例。腺癌14例,其中高分化2例,中分化4例,低分 化8例。新鲜取材,-80℃冰冻保存。
1.2 标准病毒来源
含有EBV的Raji细胞系由美国国力卫生研究院(NIH)Jackson博士赠送。
1.3 主要试剂与仪器
限制性内切StyI,分子量Marker购自华美公司。Taq酶、4×dNTP购自Promega公司。琼脂 糖购自Sigma公司。PCR扩增仪(PerkinElmerCutes480USA)。德国莱卡3000型冰冻切片机。
1.4 标本制备
取适当大小冰冻组织,冰冻切片、离心、提取消化、提取、沉淀、漂洗、干燥后溶于TE 管中-20℃保存备用。
1.5 对照病毒DNA提取
HCMV,HSV-I,VZV,购自上海第二医科大学,在病毒悬液中加入1%SDS、蛋白酶K、EDT A,42℃水浴过夜。酚—氯仿抽提,得到的病毒DNA溶解在TE中,-20℃备用。
1.6 人基因组DNA制备
参照《Molecularcloning》从血细胞中分离DNA的方法,得到人基因组DNA。用TE稀释-2 0℃保存备用。
1.7 引物
利用电子计算机和一系列引物设计和分析软件,从EBV保守区BNLF1中设计一对引物。敏 感度为fg水平,在Genbank中作同源性检索,与其它序列无显著同源。由上海细胞所用美国A BI-391型DNA合成仪合成。EBV中BNLF1引物序列如下:正链引物P15′ATCCCCAGAAACACGCGTT ACTC3′负链引物P25′GGTACAATGCCTGTCCGTGC3′扩增产物为505bp。
1.8 PCR扩增
10×缓冲液5μl,两种引物各2μl,5mmol/L,4×dNTP2ml,Taq酶2U,模板DNA5μl,去 离子水补足50μl体积,30μl液体石蜡封顶。扩增的反应参数:预变性94℃3分钟;94℃45 秒,55℃50秒,72℃60秒,三温循环,35次:最后72℃延伸7分钟。
1.9 引物特异性测定
用上述PCR扩增体系及反应参数,以标准EB病毒,HCMV,HSV-I,VZV和人基因组DNA为模 板,用去离子水为阴性对照扩增。
1.10 40例肺癌标本扩增
以标准EB病毒为阳性对照,同上扩增。
1.11 结果判定
取10mlPCR扩增产物行2%琼脂糖凝胶中(含EB0.5ml)电泳,紫外投射仪观察。
1.12 产物酶切分析
取PCR扩增产物100ml,加冷无水乙醇沉淀DNA,用70%乙醇漂洗两次,最后溶解在50ml去 离子水中,加入StyI反应缓冲液及酶中,37℃消化1小时,70℃灭活后,2.5%琼脂糖凝胶电 泳,紫外光下观察和照相。
2 结果
标准EBV可扩增出505bp的靶片段,对HSV-I,HCMV,VZV和人基因组DNA均无扩增产物出 现,说明该引物是特异的(图1)。
40例肺癌标本扩增11例阳性,总阳性率为27.5%(11/40)。其中腺癌阳性率为35%。
产物酶切分析:标准病毒用StyI消化,可产生三条248bp,150bp,107bp靶片段,与计算 机分析结果一致;在11例阳性结果中9例与标准病毒完全相同,被切成三段。有2例仅见到两 条带,分别为398bp、107bp(图2)。
A:分子量标准(1543,994,695,515,237bp)B:标准EB病毒
C:HSV-ID:HCMVE:VZVF:人基因组DNA
G:去离子水阴性对照
图1设计引物对EB病毒的特异性扩增结果
A:分子量标准(1543,994,695,515,377,237bp)
B,D,E,F为阳性标本扩增产物酶切结果
(E、D与EBV酶切结果相同,B、F与标准EBV酶切结果不同)
C:标准病毒扩增产物酶切结果
图2 扩增产物StryI酶切结果
3 小结
本研究通过特异性扩增实验和扩增产物酶切分析实验证明,设计引物是特异的。设计引 物扩增区域为BNLF1片段,它是LMP1蛋白的基因区域。LMP1是重要的转化蛋白,具有肿瘤基 因产物的特性,是EBV致癌的重要物质。因此,用设计EBV-BNLF1引物扩增检测分析癌瘤组 织中EBV感染情况及其致癌关系上比引物扩增其它区域更为直接、更有价值。
40例肺癌组织中EBV-BNLF1DNA扩增结果中,肺鳞癌与肺腺癌阳性率差异有显著性,低分 化肺癌与高中分化肺癌阳性率差异有显著性。这与张雷等报道用PCR方法检测结果一致。对E BV-BNLF1基因片段及其表达产物的检测结果,提示肿瘤组织中EBV-BNLF1基因片段及LMP1 的表达是EBV潜伏感染的一个客观指标,也可能是EBV致癌的关键环节。
笔者对40例中11例阳性标本用StyI进行酶切分析,其中有2例产物特殊,只有两条带,说 明该2例靶片段核酸序列与标准病毒不同。推测可能由于变异所致,变异及其变异情况的确 定有待于核酸序列分析结果。如有变异发生,可能与肺癌的发生机制有关,有待于进一步深 入研究。
收稿1999-03-06