急性粒-单核细胞白血病CBFβ-MYH11融合基因转录本和inv(16)的检测
中华血液学杂志 1998年第1期第19卷 论 著
作者:何凯莉 顾柏炜 曹琪 苏欣莹 陈赛娟 陈竺
单位:200025 上海第二医科大学附属瑞金医院、上海血液学研究所
关键词: 白血病,粒-单核细胞性,急性;融合基因,CBFβ-MYH11;聚合酶链反应;荧光原位杂交
摘要 目的:探讨inv(16)和CBFβ-MYH11融合基因在急性髓系白血病M4EO型的临床诊断、预后判断中的意义。方法:用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和荧光原位杂交(FISH)技术分别检测急性粒-单核细胞白血病(M4)患者的CBFβ-MYH11融合基因转录本和inv(16)。结果:在15例中国人M4中,10例患者用RT-PCR方法检测CBFβ-MYH11融合基因转录本,其中9例不伴异常嗜酸粒细胞的M4中有1例阳性;1例伴异常嗜酸粒细胞增多(M4EO)为阳性。随访该例完全缓解2个月后,其PCR仍持续阳性。用FISH技术检测的9例M4中得到的2例阳性病例,与PCR方法测得的结果完全一致。结论:对M4患者无论其经典的染色体核型分析有无16号染色体异常的提示,都应用RT-PCR和FISH方法检测CBFβ-MYH11融合基因进行筛选,这对M4的临床诊断、预后判断等具有重要临床价值。
Detection of CBFβ-MYH11 fusion transcript and inv(16)(p13;q22) in acute myelomonocytic leukemia(M4) by RT-PCR and FISH He Kaili,Gu Buowei,Cao Qi,et al.Shanghai Institute of Hematology,Shanghai Second Medical University,Shanghai 200025
Abstract Objective:To study the clinical significance of inv(16) and CBFβ-MYH11 fusion gene in the diagnosis and prognosis for M4Eo.Methods:CBFβ-MYH11 fusion transcripts and inv (16) were analyzed by reverse-transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR) and fluorescence in situ hybridization(FISH),respectively,in acute myelomonocytic leukemia(M4) with or without eosinophilia.Results:In fifteen cases tested,one case of M4Eo and one of 9 M4 without eosinophilia were found to have CBFβ-MYH11 fusion transcript.Follow-up of the M4Eo patient showed residual PCR positivity 2 months after complete remission.Conclusion:The data suggest that screening by both RT-PCR and FISH should be performed in all AML-M4 regardless of morphologic features to allow accurate diagnosis and prognosis of M4 patients.
Key words Leukemia,myelomonocytic, acute Fusion gene,CBFβ-MYH11 Polymerase chain reaction Fluorescence in situ hybridization
急性髓细胞白血病(AML)中急性粒-单核细胞白血病(M4)伴异常嗜酸粒细胞增多这一独特亚型被定名为AML-M4EO,以往的诊断主要根据细胞形态学、组化以及嗜酸粒细胞比例[1]。由于该亚型在M4中预后较好,故提高检出率尤具临床意义。绝大部分M4EO都提示有16号染色体结构异常,较为特异和常见的是16号染色体倒位,即inv(16)(p13;q22),但用传统的核型分析,特别是R带技术检出率较低。随着对16p和16q断裂点的克隆,已明确inv(16)累及的是16号染色体长臂的CBFβ基因和短臂的MYH11基因,倒位的结果形成CBFβ-MYH11融合基因[2,3]。我们建立了半筑巢式逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,用以检测该融合基因转录本,并联合运用荧光原位杂交(FISH)技术对受累基因的重排进行检测,为研究M4EO白血病的发病机制、临床诊断及预后判断提供了特异的分子标志。
材料和方法
1 标本来源 15例患者样本由上海第二医科大学瑞金医院、仁济医院,上海市第一人民医院,上海医科大学中山医院提供,其中男10例,女5例,年龄为3~74岁。根据FAB标准分类法诊断,14例为M4,1例为M4EO,标本来自初发和完全缓解后2个月。
2 细胞遗传学 15例患者的骨髓和(或)外周血经短期培养(37℃,24小时),用秋水仙素终止于有丝分裂中期,应用R带和(或)G带技术进行染色体显带分析,分析15个以上分裂中期细胞,核型分析根据染色体国际命名法(ISCN1991)。
3 半筑巢式RT-PCR检测CBFβ-MYH11转录本
3.1 RNA制备:应用一步法异硫氰酸胍-酚-氯仿抽提细胞总RNA[4]。
3.2 RT-PCR法:根据CBFβ-MYH11融合基因顺序,并参考文献[5,6],设计了5个寡核苷酸引物和探针(模式图见图1):逆转录反应引物A,第一步PCR反应引物B、C,第二步PCR反应引物D(3′端引物同C),寡核苷酸探针E。其顺序如下:
A:CTCTTGTAGCTGCATGAGGTCTG
B:5′-GACGGCAAGGTATATTTGAAG-3′
C:5′-CTCTTCTCCTCATTCTGCTC-3′
D:5′-GGGCTGTCTGGAGTTTGATG-3′
E:AGGAAATGGAGGTCCATGAG
3.2.1 逆转录反应:在40μl总体系中进行,包括总RNA 1μg,逆转录引物100ng,500mmol/L dNTP,MMLV逆转录酶200U,于37℃孵育45分钟。
3.2.2 PCR反应:反应总体积为50μl,包括寡核苷酸引物0.3μmol/L,dNTP浓度各为200μmol/L,缓冲液浓度Tris-HCl 10mmol/L,pH8.4,MgCl2 1.5mmol/L,Taq聚合酶1.5U。扩增条件为94℃变性5分钟,94℃变性45秒,退火57℃1分钟,72℃延伸1分30秒,共30个周期,最后1周期延伸时间为72℃7分钟。第二步反应的模板为第一步反应产物100倍稀释后取10μl,退火温度59℃,共25个周期。每一反应均设阴性对照,包括非M4 RNA标本和无RNA标本的空白对照。
3.2.3 PCR产物的检测:取10μl PCR产物,在1.6%琼脂糖凝胶进行电泳,用溴乙锭(0.5μg/L)染色,紫外灯下照相。
3.2.4 PCR产物的测序:取第二轮PCR产物5μl,加入exonucleasel和Shrimp alkaline phosphatase预处理。利用Sanger末端终止法原理,采用 Dye Terminnater标记法,在ABI377自动测序仪上,用4%聚丙烯酰胺凝胶进行垂直电泳,电压1.68kV,电流50mA,约7小时。
4 FISH 从法国人类多态性研究中心(CEPH)的酵母人工染色体库筛选出的854E2克隆作为探针,它跨越16p13区域[2],经inter-Alu-PCR扩增后,将Biotin-21-dUTP以缺口平移法标记YACDNA探针,同时掺入3H-dATP以监测Biotin的掺入率约40%。原位杂交法:总杂交体系12μl,含90ng的YACDNA,1000×胎盘DNA(10mg/ml),50%甲酰胺,2×SSC,10%硫酸葡聚糖,pH8.0。将探针在72℃变性8分钟后,在37℃温育1小时进行预杂交。玻片在70%甲酰胺,2×SSC,pH7.0的变性液中70℃变性2分钟,并经70%,80%,90%,100%系列乙醇脱水。将预杂交后的探针加入玻片上,盖上盖玻片(22mm×22mm),用胶封片,置湿盒中37℃杂交过夜。次日,将玻片在45℃的50%甲酰胺,2×SSC,pH7.0溶液中洗涤3次,每次3分钟;2×SSC(pH7.0)溶液中洗涤3次,每次2分钟;0.1×SSC洗涤2次,每次2分钟;BN溶液中洗涤1次。经Biotin标记的探针再用Avidin-FITC(5μg/ml),然后再用单抗Avidin抗体(10μg/ml)检测。最后染色体加碘化丙锭(0.8μg/ml)/抗淬灭剂染色。选择NikonUFX-DX荧光显微镜双色滤片组合B-2A进行观察,并通过染色体自动分析仪Cytovision进行图像摄取和分析。染色体R带显带法:用Hoechst 33258(100μg/ml)溶液染色15分钟,用水漂洗后将玻片浸于水中,置365nm紫外灯下照射20分钟,并于87.5℃的Earle液中加热3分钟后经42℃1×BN溶液浸泡1分钟,再置室温1×BN中。
A~D为寡核苷酸引物;E为寡核苷酸探针;nt495为CBFβ基因的断裂点;nt994,1201,1921为MYH11基因的断裂点
图1 用RT-PCR扩增CBFβ-MYH11融合基因的模式图及测序结果
结 果
1 细胞遗传学 对15例M4患者,包括1例M4EO进行染色体分析,除1例M4EO患者可见明显的16号染色体异常外,14例M4中有1例亦可检测到inv(16)。
2 半筑巢式PCR技术的特异性 在10例受检的M4患者中,2例细胞遗传学证实有inv(16)的患者均见分子量一致的扩增条带(322bp)并用直接测序的方法对第二轮PCR产物测序,证实为剪接转录本A型,证明此法对CBFβ-MYH11融合基因转录本的检测有高度特异性。
3 半筑巢式PCR技术的敏感性及其与DNA印迹法的比较 为探讨该法的灵敏度,我们对1例阳性患者进行敏感度测定,取其1μgRNA,以非M4白血病患者RNA作为稀释剂进行1∶10~1∶107连续稀释,再进行半筑巢式PCR反应。结果患者RNA稀释至1∶104时,仍可见反应扩增带,反映了本法的敏感性(见图2)。
1~7表示将1μgRNA进行1∶107至1∶10稀释;8为阳性病例12的RNA,未做稀释;9为阴性对照;
M为PGEM7zf(+)HaeⅢmarker
图2 RT-PCR检测转录本的敏感度测定(特异探针杂交结果)
4 FISH检测结果 9例受检的M4患者中,有2例(M4 1例,M4EO1例)在80%~90%的分裂相中,一条16号染色体可见到四个荧光信号,其中一对位于16号染色体的16p13区带,另一对位于16q22区带;另一条16号染色体在其短臂上有一对荧光信号。
15例M4患者的细胞形态学、细胞遗传学、RT-PCR和FISH结果比较见附表。
讨 论
inv(16)的结果是16号染色体长臂的CBFβ基因与短臂的MYH11基因发生重排,产生CBFβ-MYH11融合基因。CBFβ链不直接结合DNA,而是通过与CBFα形成异二聚体来增加α链与DNA结合的亲和力,稳定该异二聚体的稳定性。目前已识别了一些CBF结合位点,它们存在于TCR、GM-CSF、GM-CSF受体、髓过氧化物酶及中性粒细胞弹性蛋白基因的调控区,因此可能是由这些基因的表达失控而致白血病。CBFβ-MYH11嵌合蛋白如何诱导粒系转化尚不清楚,研究提示它保持了与CBFα(AML1)相互作用的能力,因此可能是在正常情况下由CBFα调节的目的基因上的转录复合体发生活性改变而引起粒系转化。随着研究的进一步深入,CBFβ-MYH11融合基因在M4EO的致病的重要作用将日益明了。
附表 M4患者临床资料、PCR、FISH检测结果
例号 |
性别 |
年龄(岁) |
FAB亚型 |
细胞遗传学 |
嗜酸粒细胞比例 |
PCR |
FISH |
1 |
男 |
14 |
M4 |
46,XY |
0 |
|
- |
2 |
男 |
74 |
M4 |
46,XY |
0 |
|
- |
3 |
男 |
64 |
M4 |
46,XY |
0.010 |
|
- |
4 |
男 |
29 |
M4 |
46,XY |
0 |
|
- |
5 |
男 |
14 |
M4a |
46,XY |
0.015 |
- |
|
6 |
男 |
60 |
M4a |
46,XY |
0 |
- |
|
7 |
女 |
74 |
M4 |
46,XX |
0 |
- |
|
8 |
男 |
48 |
M4 |
46,XY |
0 |
- |
|
9 |
女 |
8 |
M4 |
46,XX |
0 |
- |
|
10 |
男 |
64 |
M4 |
46,XY |
0 |
- |
- |
11 |
女 |
11 |
M4b |
46,XX |
0.010 |
- |
- |
12 |
男 |
37 |
M4a |
46,XY,inv(16) |
0.010 |
+ |
+ |
13 |
男 |
43 |
M4EO |
46,XY,inv(16) |
0.100 |
+ |
+ |
14 |
女 |
3 |
M4 |
46,XX |
0 |
- |
- |
15 |
女 |
53 |
M4b |
46,XX |
0.010 |
|
- |
研究结果提示,CBFβ基因断裂点恒定地位于3′端编码区的17个氨基酸处(nt495),而MYH11基因的断裂点存在5种不同方式,因此根据MYH11断裂点的不同,CBFβ-MYH11转录本有5种不同的剪接方式,但最常见的为A型(即MYH11基因的断裂点在于nt1921),占80%[5],其余均少见。我们应用的半筑巢式PCR反应检测到的2例阳性患者均为A型,在以后的研究中,有必要设计针对其它断裂点的引物,以期发现其它的剪接转录本类型。
该方法所需标本量少(1μgRNA),其敏感度达到可检测100pg白血病细胞RNA,但实际仅用1/4逆转录反应产物、1/100第一轮PCR产物分别作为第一轮和第二轮PCR反应模板,1/5的扩增产物进行分析。所以,扩增条带的产生实际来自0.05pg白血病细胞总RNA。据推算,我们可在2×105个正常细胞中检测到1个携带CBFβ-MYH11融合基因的白血病细胞,由此可见本法的敏感度之高。
我们在1例不伴异常嗜酸粒细胞的M4患者体内检测到转录本,提示用RT-PCR和FISH技术筛选M4患者有助于对这些病例的精确诊断和预后评估。
我们在1例M4EO患者中检测到转录本和inv(16),这与国外文献报道相一致,但inv(16)在M4EO中的发生率至今仍不肯定。Larson等[6]调查了M4EO患者33例,发现27例伴inv(16),6例伴t(16;16)。Campbell等[7]从反方向研究细胞遗传学与血液学间的联系,他们报道了26例伴inv(16)(p13;q22)或t(16;16)(p13;q22)的病例,16例为M4EO,其余10例为M2、M4、M5、骨髓增生异常综合征,而这10例中6例伴嗜酸粒细胞增多。现认为,inv(16)是M4EO特征性的异常核型,它所形成的CBFβ-MYH11融合基因可作为M4EO的分子生物学标志。
我们跟踪了1例M4EO伴inv(16)完全缓解约2个月的患者,PCR检测仍呈阳性,说明RT-PCR为微量残留病(MRD)检测的优选方法,对该例患者的进一步随访有助于MRD的监测。FISH技术是近年来发展起来的新技术,它的优点在于可对单个细胞进行基因的诊断和残留白血病细胞检测。我们在中期分裂细胞检测到携有inv(16)的病变细胞,而且适当的探针(如YACDNA探针长达数百kb)不受融合基因异质性的影响。复发早期患者,其体内残留的白血病细胞正处于分裂增殖的旺盛期,此时FISH可直接观察到增殖期的白血病细胞,能更直接地反映病情状况,及时预报复发。对未分裂细胞,FISH能在短时间内对大量间期核进行快速检测。将RT-PCR与FISH技术相结合,将对疗效监测、预后判断都有实际临床应用价值。
参 考 文 献
1 Bloomfield CD,Arthur DC.Del(16)(q21 or 22)and eosinophilia in acute nonlymphocytic leukemia(ANLL):a new cytogenetic-clinical association.Proc Am Soc Clin Oncol,1982,38:191.
2 Liu P,Terle SA,Claxlon DF,et al.Fusion between transcription factor CBFβ/PEBP2β and a myosin heavy chain in acute myeloid leukemia.Science,1993,261:1041-1044.
3 Chomczynski P,Sacchi N.Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction.Anal Biochem,1987,162:156-159.
4 Poirel H,Radford-Weiss I,Kalrina R,et al.Detection of the chromosome 16 CBFβ-MYH11 fusion transcript in myelomonocytic leukemia.Blood,1995,85:1313-1322.
5 van der Reijden BA,Lombardo M,Dauwerse HG,et al.RT-PCR diagnosis of patients with acute nonlymphocytic leukemia and inv(16)(p13;q22) and identification of new alternative splicing in CBFβ-MYH11 transcripts.Blood,1995,86:277-282.
6 Larson RA,Williams SF,le Bean MM,et al.Acute myelomonocytic leukemia with abnormal eosinophils and inv(16) or t(16;16) has a favorable prognosis.Blood,1986,68:1242-1249.
7 Campbell LJ,Challis J,Fok T,et al.Chromosome 16 abnormalities associated with myeloid malignancies.Genes Chrom Cancer,1991,3:55-61.
(收稿:1997-03-31)
(校对:张志方)