慢性粒细胞白血病降钙素基因甲基化的研究
中华血液学杂志 1998年第1期第19卷 研究报告
作者:王顺清 洪文德 彭爱华 罗绍凯 戴木水 戴丽君
单位:510180 广州市第一人民医院(王顺清);中山医科大学附属第一医院(洪文德、彭爱华、罗绍凯、戴木水、戴丽君)
慢性粒细胞白血病(CML)是起源于多能干细胞的肿瘤性疾病,其急变发生的机制不清楚。近来有人报道人类降钙素基因(Calcitonin gene,CT基因)的高度甲基化与不少肿瘤性疾病有关,我们利用限制性内切酶和聚合酶链反应(PCR)技术,检测了不同时期CML患者CT基因甲基化状况,以探索CT基因甲基化与CML疾病分期和进展的关系。
材料和方法
1 标本来源 31例CML患者骨髓或外周血,其中慢性期21例,急变期10例。阴性对照10例,其中5例为非恶性疾病患者手术切除的肋骨中的骨髓,另5例为非恶性的贫血患者骨髓;阳性对照为白血病细胞系K562和HL-60。用淋巴细胞分离液分离骨髓或外周血的单个核细胞,PBS洗涤3次。
2 DNA提取和定量 用常规的酚/氯仿法抽提上述单个核细胞的大分子量DNA,紫外分光光度计分别测定260nm、280nm和330nm处紫外吸光度A(曾称光密度OD),计算出DNA浓度及纯度,要求DNA达到酶切所需纯度。
3 限制性内切酶消化 酶切体系总体积50μl,底物DNA 1μg,在厂家所提供的条件下加内切酶HpaⅡ10U,37℃水浴16小时。
4 引物 参考文献[1]设计跨越第4个CCGG这一甲基化位点(M4)的一对引物,有义链为5′-CCTCTGATCCAAGCCACCTC-3′,反义链为5′-CGCCTGCTGGCACCTCAGTC-3′。因为HpaⅡ能特异性地切断CCGG位点,当CCGG位点发生甲基化变为CCmGG时,HpaⅡ就不能将其切断,所以将细胞基因组DNA进行酶切,如果M4位点已甲基化(CCmGG),HpaⅡ不能将这一点切断,用上述引物就能扩增出一个566bp的特异性片段;相反,如果M4位点未甲基化而被HpaⅡ切断,则不能扩增出这一特异性片段。
5 PCR反应 反应总体积50μl,含10×PCR缓冲液5μl,5mmol/L dNTP 2μl,5μmol/L引物2.5μl,25mmol/L MgCl2 3μl,已被HpaⅡ酶切的DNA 100ng
(5μl酶切产物)及双蒸水适量,无菌石蜡油50μl。先置95℃变性10分钟,迅速冷却至4℃,加入Taq DNA聚合酶各1.25U,PCR循环条件为:94℃变性,55℃退火,72℃延伸各1分钟,总共35个循环,末次延伸10分钟。
6 电泳及观察 取PCR扩增产物15μl于2%琼脂糖凝胶中电泳,EB染色,紫外透射反射仪下观察、照相,用λDNA-EcoRⅠ/HindⅢ作为分子量参照物。
7 光密度仪扫描及PCR产物定量分析 照相后负片用光密度仪扫描对PCR产物进行半定量分析。
结 果
如附图所示,两个正常对照和两个阳性对照均分别出现两条带,一条为566bp,另一条为639bp。从附图可看出,正常对照者639bp的条带很明显而CT基因特异性的566bp条带较淡;相反,在两个阳性对照中566bp条带要比639bp条带强得多。我们利用639bp这一非特异性扩增产物作半定量处理,即用TLC扫描仪把所有标本的这两条带进行吸光度检测,计算机分析,并计算出每个标本这两条带的吸光度比值(A566/A639),并参考文献[1]报道,将A566/A639比值≥1者定为阳性,<1者定为阴性。
1,2为正常对照,均阴性;3为HL-60细胞;4为K562细胞;M为标准分子量
附图 K562、HL-60(阳性)及正常对照(阴性)的CT基因的PCR图谱
按上述标准,10例阴性对照全部阴性,21例慢性期CML患者中有5例出现阳性,10例急变期CML患者有8例为阳性(结果见附表)。CML的慢性期和急变期CT基因甲基化阳性率有显著性差异。
附表 CML患者CT基因两条带A566/A639值的比较(±s)
组别 |
例数 |
A566/A639 |
P值 |
CML慢性期 |
21 |
0.6315±0.5071 |
P1>0.05 |
CML急变期 |
10 |
2.1516±1.7819 |
P1<0.005,P2<0.001 |
阴性对照组 |
10 |
0.3243±0.1462 |
|
注:P1为与阴性对照组比较;P2为急变期与慢性期比较 有两例患者分别检测了慢性期和急变期CT基因甲基化状况,在急变期均呈阳性,其中1例在慢性期即为阳性,两个月后发生急变;另1例慢性期阴性,在9个月后出现急变。另外慢性期阳性的4例患者除1例失访外,其余分别于5,6,14个月发生急性变。
讨 论
我们的研究表明76.2%的慢性期CML患者未发现有CT基因高度甲基化,而在急性变期有80%出现了甲基化,此与文献[2]报道很相似。Nelkin等[3]还报道加速期(8例中5例)也有明显的CT基因甲基化,这些结果表明CT基因的甲基化与CML的发生关系不大,但与CML的进展、急变密切相关,因此CT基因高度甲基化可以看作是CML进展的一个分子标志。
Malinen等[2]对那些慢性期即检测到有CT基因高度甲基化的CML患者进行追踪观察,发现他们在2到27个月(平均10个月)内发生了急变。我们所观察的4例CT基因甲基化呈阳性的CML慢性期患者,也分别于2~14个月发生了急性变,CT基因甲基化发生在CML急变之前。Malinen等[2]认为在CML急变之前,可以比临床表现或细胞形态学改变大约提前6个月左右发现CML的进展进入加速期或急变,因此检测CT基因的甲基化可用以监测CML的进展,预测急变的发生,以指导积极的治疗。
从我们的实验看到,正常对照和一些慢性期的标本也扩增出较淡的特异性片段,这可能与HpaⅡ不能将DNA彻底消化有关,加上PCR的高度敏感性,即使有很微量和未切断的DNA也能扩增出少量的特异性片段。但经过前述的内对照处理,仍能发现CML慢性期与进展期之间的明显差异,本方法可用以监测CML的进展、预测急变的发生和指导治疗。
参 考 文 献
1 Fukuhara T,Hooper WC,Baylin SB,et al.Use of the polymerase chain reaction to detect hypermethylation in the calcitonin gene.A new sensitive approach to monitor tumor cells in acute myelogenous leukemia.Leuk Res,1992,16:1031-1040.
2 Malinen T,Palotie A,Pakkala S,et al.Acceleration of chronic myeloid leukemia correlates with calcitonin gene hypermethylation.Blood,1991,77:2435-2440.
3 Nelkin BD,Przepiorka D,Burke PJ,et al.Abnormal methylation of the calcitonin gene marks progression of chronic myelogenous leukemia.Blood,1991,77:2431-2434.
(收稿:1996-09-02)
(校对:张志方)