根据我国的承诺，在加入WTO以后，将在五个方面保障医药行业的市场开放与公平竞争，国内医药行业将因此受到许多影响。
加强药品知识产权保护击中医药行业的“软肋”
我国承诺的第一条是加强对知识产权的保护。我国目前所生产的化学药品，只有两个化合物具有自主知识产权，其余约98％的化学新药是仿制的。近几年我国企业自身的技术创新能力受到重视，大部分大型企业都建立了新药研究机构，但由于新的功能化合物非常难寻，因此对于国内外的制药企业来说，发明一个化学新药的难度与成本是非常高的，而购买新药的生产权，价格也非常高。因此加入WTO以后，我国的化学制药企业，可能在相当长的一个时期内，出现没有新药生产的局面。当然，生产专利过期的通用名药也可以维持企业生存。
对于中药来说，由于标准化与现代化发展滞后，在知识产权方面仍然非常薄弱。而随着国际制药巨头纷纷加大对中药的研究，中药的知识产权问题已越来越突出。我国有中药企业1600多家（含兼产），产值约占我国医药工业的21．5％，出口额约占国外中药与天然药物市场的3％，大部分是原料，与中药大国的地位极不相符。中成药进出口出现了连续两年多的贸易逆差，上半年成为医药行业唯一出口下降的领域，下降幅度为5．8％。这表明，在中药还没有跨出国门的时候，洋中药已开始进军国内市场了。我国中药产业是否又要走化学制药的老路，值得我国中医药产业发展决策者的思考。
对生物制药行业来说，影响可能复杂一些。首先，对于现有生产企业和生产品种来说，大部分都可能存在知识产权的问题，但由于生物技术药物从基因到产品的整个过程可变因素非常多，可争议的地方非常多，影响也比较复杂。其次，我国生物技术制药已逐步步入自我创新的发展阶段，目前在研的生物技术药物60％都有知识产权，因此从长远看，生物技术制药企业能够面对加入WTO后带来的知识产权冲击。
降低药品关税不会明显改变现有竞争格局
我国承诺的第二条是加入WTO后，制剂的关税将逐步减至6％－6.5％。我国制剂无论是从生产水平，还是产品的数量、剂型、释药系统都落后于国外先进水平。长期以来，我国一直都是出口大吨位的低附加值原料药，而进口附加值高的制剂。目前，进口药品的关税为14％。
但降低关税以后，并不会出现大量的制剂产品涌入国内的局面。因为：第一、在劳动力生产成本上，国内具有一定的优势，国外企业从降低成本的角度出发，将会选择在国内生产而不是进口制剂成品。第二、国际制药巨头大部分已在我国建立了生产基地，部分企业开始建立新药研究基地。第三、国内新药申报和临床实验所需病例的丰富有利于新药上市。目前，内地有1700多家中外医药生产合资企业，其产品只有7．4％是出口的。外资制药企业的药品销售额占国内药品年销售额的25％，进口药品销售额仅占12％，在我国建立的外资制药企业生产的药品和进口药品已占全国大城市医院药品年销售额的60－65％。因此与目前市场格局相比，入世后不会有太大的改变。当然，对我国制药生产企业来说，压力可能大一些。 取消进口大型医疗设备的行政管制影响不大
我国承诺的第三条是2003年取消对医疗器械的行政管制。我国医疗器械生产一直以技术含量低的器械为主，如手术器械、保健器械等，这些产品在我国的医药产品出口业务中占据着重要地位，但大型医疗器械是我国医药行业的薄弱环节，尤其是象核磁共振、X-射线断层诊断仪等。2001年上半年医药行业进口额为16亿美元，其中增长幅度最大的是医疗器械，达3.89亿美元，与2000年同期相比增长31.3％。
但大型医疗器械属于耐用消费品，市场需求的增长空间有限，而且我国大中型医院的高档医疗器械已出现饱和，利用率已经非常低，因此进口继续增长有限。在这一领域，能够生产的国内企业也不多，但对于部分公司如万东医疗、东软股份、威达医械还是有一定的影响。 开放药品分销服务将加剧流通领域的竞争
我国承诺的第四项是开放药品分销业务，外资可从事批发与零售业务，并可控股。目前我国药品批发企业有16000多家，药品零售企业116000多家。行业集中度非常低，企业盈利能力很弱。2000年统计资料表明，虽然药品批发毛利率在12％以上，高于美国水平，但净利率仅0.6％，远远低于美国2．4％的水平。而作为药品终端销售体系中重要的组成部分——药品连锁店的发展，还处于发展期，在规模、管理、送配体系建设方面依然比较差。
随着外资的进入和批发与零售业务的开放，行业竞争将会进一步加剧，市场平均利润将会继续降低。所以对于流通类上市医药公司来说，开放药品分销业务，是一个利空。
开放医疗服务将带来许多投资机会
我国承诺的第五条是开放医疗服务业。长期封闭发展的我国医疗产业还存在以下不足：一是卫生资源配置不合理，全国80％的卫生资源集中在城市，而且80％又集中在大城市；省会城市和部分100万以上人口的城市千人拥有病床6.59张，医生4.46人。二是大型医疗设施拥有量居国际前列，乱收费现象普遍，利用率低；三是医疗收费不合理，以药养医现象突出。
以上不足，除了所有者缺位外，另外一个原因就是缺乏竞争。作为医疗服务业中一个重要组成的营利性医院在我国还处于萌芽期，而在西方许多发达国家，一般占有10％以上的市场份额。我国在2000年相继推出了中外合资医疗机构管理办法和医疗机构分类管理办法，加快了我国医疗服务业对内外开放的步伐。但由于观念落后，资本进入医疗服务业在许多地方依然存在许多障碍。但从长远来看，资本市场投资医疗服务业的企业将会越来越多，毕竟其中商机诱人。
从以上分析可以看出，加入WTO以后，我国医药行业将会受到巨大冲击，但仍有可迂回的空间。如何应对挑战，持久战应是必然选择。
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