(1)氨的吸收：当食糜进入大肠后，未经完全吸收的蛋白质和其他含氮物质经大肠内的细菌分解产生氨。因大肠内细菌很多，小肠内几乎无细菌，所以大肠是产氨最多的部位。大肠内的氨以分子形式的NH3通过弥散作用进入肠粘膜而被吸收。肠内呈碱性时，有利于氨的吸收，肠内呈酸性时，不利于氨的吸收，正常人每日从肠道吸收4克氨。
氨是有毒的物质，能参与生化代谢。氨吸收后被血液运至肝脏，通过鸟氨酸循环合成尿素，由肾脏排出或被利用于蛋白质合成。另一部分与α- 酮戊二酸还原氨基化形成谷氨酸。还有小部分氨随粪便排出体外，粪便中氨的含量约为4mEq/L。
氨在结肠中产生并吸收，对正常人无临床意义，因为门脉血流中的氨迅即由肝脏解毒，但在肝硬变，门脉高压的病人，从结肠内吸收的氨是导致肝昏迷的重要原因。
(2)胆汁酸的吸收：肝脏分泌的胆汁进入肠腔后，大部分在回肠吸收，少部分在大肠吸收，剩余的从粪便排出。被吸收的胆汁酸经门静脉入肝，重新组合成胆汁酸，再排入小肠，这个过程称为胆汁酸的肠肝循环。
胆汁酸在结肠吸收量很少，只有5%～10%的胆汁酸由结肠吸收，但它对结肠吸收水和电解质的功能却有很大影响。如结肠吸收胆汁酸的功能障碍，或进入结肠的胆汁酸过多，超过结肠的吸收能力，滞留于结肠内的胆汁酸受细菌的分解和代谢，产生的胆酸和去氧胆酸等物质，能抑制水和电解质的吸收，可引起胆汁性腹泻。
(3)葡萄糖和挥发性脂肪酸的吸收：结肠粘膜能被动的吸收葡萄糖，不能吸收的六碳糖混在食物残渣中，在大肠细菌的作用下，分解成短链脂肪酸，其中的一半为挥发酸。大肠内的挥发酸以醋酸含量最高，约占60%，而丙酸、丁酸较少。这些挥发性短链脂肪酸组成大肠中的主要有机负离子，其中大部分被结肠吸收，一部分被细菌继续分解成氢气、二氧化碳和甲烷等气体，部分随粪便排出体外。肠道患病时，结肠内挥发性脂肪酸增多，肠道内的酸度和浓度均增高，由于渗透压的作用，吸收水分入肠腔，粪便容积随之增加，引起渗透性腹泻。
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