我国地域广阔，民族众多，自然、地理、饮食、生活、从业情况差别很大，因而胆石病的地区分布存在很大差异。
在南方诸省，胆管结石的发病率高。如四川省是原发性胆管结石发病率高的地区，华西医科大学冉瑞图等分析1938～1987年的胆石症病例，原发性胆管结石病例占65.9%，其中肝内胆管结石占18.7%。
沿海地区，如福州地区胆管结石的发病率占91.27%，其中肝内胆管结石占胆管结石的42.6 %；广东汕头地区肝内胆管结石占总数的43.1%；广西壮族自治区，病人以农民为多，肝胆管结石发病率占胆石病人的79.1%，此种情况亦见于西南地区的贵州与云南的少数民族地区。
西北和华北诸省少数民族中，肝内胆管结石相当少见。如西北、华北胆管结石的发病率只占胆石病总数的4.8%和4.1%，并且这些病人有许多是从内地移居的。
大城市中胆囊结石发病率高，如北京、上海、天津等城市。上海的肝内胆管结石相对发病率为4.55%，较其他沿海城市为低，原因是城市内大量的胆囊结石病人降低了胆管结石的相对发病率。
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