确定肛门直肠周围脓肿性质及范围，对治疗脓肿有重要意义。
①视诊：观察肛门局部的皮肤色泽及形态。可见脓肿处红肿热痛，不可触摸，将溃时变为白色。破溃后脓汁厚稠色黄量多者，多为金黄色葡萄球菌所致的急性炎症；而混有绿色脓汁者，多为绿脓杆菌感染；脓汁色黄且臭者，多为大肠杆菌感染；脓色清稀或如豆渣样，多为结核杆菌感染。若脓血相柔，似果冻状物，应考虑为癌变。
②指诊：对确定脓肿的形态，性质，位置，有无瘘管，瘘管走行如何，脓肿涉及哪个层次，有很重要的意义。
③探针及着色检查：可以确定脓肿感染的内口，及脓肿范围，瘘管走向。
④内窥镜检查：观察直肠内有无内口、脓血及其他病变。
⑤脓汁培养及活体组织检查：确定致病菌和病变的性质。
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