国外学者研究认为，一些患者肌张力有改变或精细运动缺损，这些神经系统体征提示有器质性损害。而围产期有损伤病史的儿童发病率亦高，亦支持以上结论。从少数尸解报告(因本病是非致死性疾病，尸解病例很少，多为个案报告)发现在纹状体含多巴胺丰富细胞群中有一种异常的细胞类型，这种异常细胞可能是损伤后的结果，也可能是本病的病理学基础。另有人在尸解中进行精细细胞系统病理学和免疫组织化学检查后发现，抽动一秽语综合征患者苍白球外侧背部完全缺乏dynorphin样阳性绒毛样纤维，腹侧亦很少。因此认为从纹状体纤维投射致苍白球中的dynorphin减少，可能为此病病人的脑病理改变。影像学检查见到，18例抽动-秽语综合征患者全部左苍白球明显小于右侧。豆状核平均体积比正常人小，两侧基底节体积不对称。
从以上国内外资料看，基底神经节的病理性改变可能是抽动-秽语综合征的病因，亦即此病可能合并基底神经节部位的器质性改变。
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