p16基因异常与慢性粒细胞白血病关系的研究
中华血液学杂志 1999年第11期第20卷 研究报告
作者:许多荣 洪文德 童秀珍 彭爱华 罗绍凯
单位:510080 广州,中山医科大学附属第一医院血液科
我们采用半定量多重聚合酶链反应(PCR)和PCR-单链构象多态性(SSCP)检测了48例慢性粒细胞白血病(CML)患者p16基因纯合缺失和点突变,以期从分子生物学水平探讨p16基因分子生物学异常与CML的关系。
对象和方法
1 对象 12名正常人,男性7名,女性5名,平均年龄31.6岁。48例CML患者,其中慢性期20例,急粒变16例,急淋变12例(所有病例原始淋巴细胞+幼稚淋巴细胞≥0.20,组织化学染色都表现为糖原染色过碘酸反应强阳性,POX阴性),男性33例,女性15例,平均年龄33.6岁。K562细胞株为p16基因纯合缺失,作为p16基因缺失的阳性对照。凝血因子Ⅸ外显子4(E4)为内对照。引物由中国科学院上海细胞生物研究所合成,其序列见表1。
表1 不同基因外显子的引物序列
基因 |
引物序列 |
产物长度
(bp) |
p16基因E1 |
5′-GAAGAAAGAGGAGGGGCTG-3′ |
336 |
|
5′-GCGCTACCTGATTCCAATTC-3′ |
p16基因E2 |
5′-GCTCTACACAAGCTTCCTTTCC-3′ |
393 |
|
5′-ACGAATTCTCAGATCATCAGTCC-3′ |
凝血因子Ⅸ |
5′-CCAATGAGTATCTACAGGGG-3′ |
273 |
基因E4 |
5′-TACACCAATATTGCATTTTC-3′ |
2 方法
2.1 DNA提取:取骨髓或外周血5 ml,肝素抗凝,用淋巴细胞分离液离心收集单个核细胞(MNC),常规方法提取DNA,并进行浓度和纯度测定。
2.2 半定量多重PCR检测p16基因纯合缺失:将E1或E2和E4放在一个体系中进行多重PCR扩增。反应总体积50 μl,含1.5 U DNA聚合酶,DNA 200 ng,E1、E2、E4引物量分别为25 pmol、25 pmol、50 pmol。PCR循环条件:E1+E4: 94 ℃ 1分钟,58 ℃ 1分钟,72 ℃ 1.5分钟;E2+E4: 94 ℃ 1分钟,56 ℃ 1分钟,72 ℃ 1.5分钟,两者均为35个循环,DNA扩增产物先经20 g/L琼脂糖电泳、紫外灯下照相,负片再送TCL薄层扫描仪扫描,测出两条产物带的吸光度(A)值,计算比值。正常人应扩增出两条带,第1条为内对照凝血因子Ⅸ基因E4扩增产物,其长度为273 bp,第2条带为p16基因E1或E2扩增产物,长度为336 bp或393 bp。其比值用即A1/A4或A2/A4(A1、A2、A4分别代表p16基因E1、p16基因E2、凝血因子Ⅸ基因E4扩增产物吸光度扫描值)表示。再以3倍K562细胞DNA和1倍正常人细胞DNA多次混合扩增的比值的平均值(1=A1/A2,2=A2/A4)作为p16基因纯合缺失的标准值,本实验测得的1=1.1716±0.0913、2=1.1680±0.0841。其判断方法参考Sill等方法[1]。如患者的基因扩增后测得的A1/A4(A2/A4)小于1(2),则可认为此例患者属p16基因E1(E2)纯合缺失。
2.3 p16基因E1和E2 PCR-SSCP分析:先进行p16基因单个外显子PCR扩增,反应总体积50 μl,含1.5 U Taq DNA酶,DNA 200 ng,E1、E2引物量均为25 pmol。PCR循环条件:E1:94 ℃ 1分钟,58 ℃ 1分钟,72 ℃ 1.5分钟;E2:94 ℃ 1分钟,56 ℃ 1分钟,72℃ 1.5分钟,两者均35个循环,开始97 ℃变性8分钟,结尾72 ℃延伸5分钟。扩增后产物经聚丙烯酰胺垂直电泳、银染,观察电泳带变化,确定有无异常发生。
3 统计学分析 采用四格表χ2检验和四格表确切概率计算法。结 果
1 正常人和CML患者p16基因纯合缺失的检测结果(见图1) 12名正常人均无p16基因E1和E2纯合缺失。48例CML患者共有9例发生缺失,且E1和E2同时发生缺失。
M:分子量标准;1~9:9例CML患者
1 9例CML患者p16基因E2多重PCR扩增产物电泳图
如图1所示,扩增产物中出现两条带,第1条带为Ⅸ因子基因E4扩增产物,其长度为273 bp,第2条带为p16基因E2扩增产物,其长度为393 bp。例2、例3、例9的A1/As(A2/As)比值小于1(2),则可认为这3例患者属p16基因E2纯合缺失。
2 CML患者p16基因点突变的检测 对12名正常人和39例CML患者(48例除外9例p16基因纯合缺失)进行PCR-SSCP分析,结果均未发现有点突变发生。部分病例SSCP分析见图2。
M:分子量标准;N1、N2:正常人
2 部分CML患者p16基因PCR-SSCP电泳图
讨 论
本组48例CML患者中,只有急淋变组与正常人组比较p16基因纯合缺失差异显著,而慢性期组和急粒变组与正常人比较差异均无显著性。Ogawa等[2]报道CML慢性期p16基因纯合缺失率也很低,Sill等[1]发现50%的急性淋巴细胞白血病患者有p16基因纯合缺失,Serra等[3]在17例急性期CML病例中,检出3例有p16基因纯合缺失,且3例均为急淋变病例。这些结果提示p16基因纯合缺失与CML发生及急粒变关系不大,但与CML急淋变存在着密切的关系。实验中我们还发现,在8例急淋变p16基因纯合缺失病例中,有3例是在急变前就已发生p16基因纯合缺失,最早的1例发生在急变前3个月。p16基因纯合缺失与CML急淋变关系密切,其机制尚不清楚。目前认为,淋巴细胞内存在着某些特殊机制(如DNA重组酶活性增高),如果p16基因发生纯合缺失,细胞内缺乏p16蛋白竞争的CDK活性就增强,从而淋巴细胞性肿瘤增殖加快,而粒系肿瘤细胞增殖减慢,在细胞永生化的过程中淋巴细胞性肿瘤获得优势,最终演变为急淋变。我们在12名正常人和39例CML患者中未发现有p16基因点突变,Ogawa等[2]也报道p16基因点突变在CML中很少发生。
总之,CML p16基因点突变是一个较低概率的事件,其分子生物学异常主要是p16基因纯合缺失。临床上,利用部分CML患者在急淋变前就已发生p16基因纯合缺失这一特点,检测p16基因纯合缺失就可预测部分CML患者发生急淋变,就可在急淋变前及时采取有效治疗措施如强烈联合化疗或骨髓移植,以提高治愈率。
参考文献
1 Sill H, Goldman JM, Cross NC, et al. Homozygous deletions of the p16 tumor suppressor gene are associated with lymphoid transformation of chronic myeloid leukemia. Blood, 1995, 85:2013-2016.
2 Ogawa S, Hangaishi A, Miyawaki S, et al. Loss of the cyclin-dependent kinase-4 inhibitor (p16, MTS1) gene is frequent in and highly specific to lymphoid tumors in primary haematopoietic malignancies. Blood, 1994, 84:3122-3126.
3 Serra A, Gottardi E, Della F, et al. Involvement of the cyclin dependent kinase-4 inhibitor (CDKN2) gene in the pathogenosis of lymphoid blast crisis of chronic myelogenous leukemia. Br J Haematol, 1995, 91:625-629.
收稿:1998-08-12 修回:1999-05-28