【位置】丹田有上、中、下三个。下丹田又称气海、神炉、天根等，在脐下１．3寸，向内3寸处。中丹田又叫黄庭、上金、玄窍，在膻中穴内3寸处。上丹田又叫干顶、天谷、内院、泥丸，在印堂穴内3寸处。《大成捷要》认为穴位的大小是“方圆一寸二分，虚间一穴”。有人也认为丹田是指人身体的三个部位，即下丹田在会阴穴至气海之间，中丹田在神阙至膻中之间，上丹田在两眉间至额颅之间。
【应用】丹田是练气功培养真气和凝聚真气，筑基通周天，气行任脉的重要穴位。又是发放外气以激发、调整病人气机的重要位置。
（一）下丹田为气功练精化气，意守的重要穴位，古人有“凝神入气穴”之说，即意守下丹田的练气方法。用外气调整患者逆乱的气机时，必引导其气归于丹田，这叫引气归原。向下丹田发气有鼓舞、激发、聚练气机，驱除邪气的作用。
（二）中丹田为气功练气化神的地方。练功或外气导引气机，若不得法而使气上逆于中丹田，凝聚而不散，常可引起胸闷、胸痛、憋气等症。
（三）上丹田是气功练神还虚之处。意守上丹田可以益智，能开发人脑的潜能。但功夫不到或处理不当，意守此处常可引起头痛、头晕。从印堂穴，以震颤手法向上丹田发放外气，有催眠、安神、调整上焦气机的作用。但用三点拉线法发气，常可引起病人头晕、头昏、或昏厥等症状，应当注意。
【位置】三关是在背部督脉路线上的三个重要穴窍。尾闾关，又称辘轳关，在尾闾骨端，肛门之后上方，该处有长强穴。夹脊关，在命门之两侧，夹脊是穴。玉枕关在脑后枕骨下入脑处。
【应用】三关穴是练小周天气行督脉最不易通过之处，故又名铁壁。在气通三关时，首先是顺其自然的运行，有时很顺利，但有时则会遇到气机受阻。如尾闾关遇到障碍时，则有尾骶部酸痛、沉重和气机冲击此处而不通的感觉。此时一方面可以轻轻用意把气上引，一方面采用吸气、抵舌、提肛之法，使气通过。气至夹脊关一般比较容易通过，但少数人此处有病，则可出现酸痛、腰脊似折之感觉。玉枕关气阻最为常见，表现为颈部板硬，枕部沉重、酸痛，或似贴物，凝而不散。此时可闭目上视，微微仰头，以意引气通过即可。气通三关时，若功力不足，气机无力通过，不可随便意引。若患者气机紊乱，任督两脉气机受阻，可以发放外气于三关处，有激发、调整督脉之气的作用。所以三关也是治疗颈、腰、骶尾部疼痛的重要穴位。