(1)神经调节
①外来神经的调节：外来神经有交感神经和副交感神经(受大肠上段迷走神经支配，下段受盆神经支配)。中枢神经系统通过这两种外来神经来调节结肠运动。通常副交感神经兴奋，使肠肌兴奋，运动增强；而交感神经兴奋可产生抑制作用，使大肠运动减弱。但上述结果还应根据肠肌当时的状态而定，如肠肌紧张性高，无论交感神经或副交感神经兴奋都使之抑制；反之，如果紧张性低，则这两种神经兴奋都能使其运动增强。切断外来神经后，肠管运动无明显障碍，这主要是通过壁内神经丛的局部反射而实现。
②壁内神经丛的调节：壁内神经丛主要是肌间神经丛和粘膜下神经丛，有神经节细胞在肠壁内组成网络，构成一个简单的整合系统，调节结肠运动。该调节有两种方式：一种是机械性刺激作用于肠粘膜，传入神经到达壁内神经丛，经过整合后，调节肠肌运动，使刺激占后方的肠管收缩加强，前方的肠肌受抑制，肠管舒张，其结果使蠕动波沿着一定方向推动内容物前进。另一种是机械性刺激作用于肠壁的肌肉层，可引起牵拉部位上下方的肠管运动受到抑制。
(2)激素调节：胃泌素可加强结肠运动和排空，可能与进食后引起的胃结肠反射有关；5-羟色胺可使肠蠕动加强；前列腺素可加强结肠的推进性运动，排出内容物和气体；缩胆促胰素可加强结肠运动，而胰泌素则使前者的加强效应受到抑制。
此外，大脑皮层的活动及情绪的变化对结肠运动也有明显的影响，如惊恐、愤怒、疼痛时，通常肠蠕动减弱；但当情绪非常激动时，也会引起强烈的肠蠕动，甚至出现腹泻。
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