原始人类最早所使用的生产工具是石器和骨器，但这是从现代考古发掘所见的遗存而言，一些当时可能起过重要作用的竹木器具则未必能保存至今。原始人类的工具；不可能象后代那样专门，既是生产工具、生活用品等，同时也作为医疗用具来使用。
一、石器和砭石
石器是人类早期最重要的一种生产工具。因其资源丰富、容易加工、硬度较高等优点，在从石器时代到青铜时代的生产活动中，一直扮演着不可轻视的角色。考古学上，根据加工方式的进步程度分为旧石器，中石器和新石器三个阶段，旧石器从选材到制作都很简略，只是稍作一些加工；到了新石器，琢、磨、钻孔等技术逐渐产生，制出了比较精致适用的石器，包括生产工具、生活器物与妆饰品等。
砭石是石器的一种，是原始人类最初使用的医疗工具，有锐利的尖端或锋面。后世的医疗上常用的刀、针等就是由此发展而来的。它主要被用来切开痈肿、排脓放血，或用以刺激身体的某些部位以消除病痛。
近年研究认为考古发现的一些遗物当是古代记载中的砭石。内蒙古多伦旗头道洼新石器时代遗址出土的一根磨制石针；河南郑州商代遗址出土的一枚玉质小剑形器等，是文献记载的有力佐证，实际上砭石除了在石器时代应用外，其后的数千年间，在人群中一直沿用着。
二、骨器及其在医疗上的应用
原始先民在使用石器的同时，骨器也较普遍，山顶洞人遗址就发现了精致的骨针。骨器的普遍使用是在新石器时代。在考古发掘出土的骨制品中,生活用具占很大比重，我们很难确指哪些是用于医疗的。但是，其中的骨针、骨锥、骨刀等都有可能同时用于医疗活动。加之在制作上比制品容易，其锋利也优于石制品，用于医疗的可能性也大。后世的针灸，浅刺用针的形制就和石器时代的骨针很相象。山东曲阜孔庙的东汉画像中，有一幅鹊身人首神医治病图，手执之医疗器具很可能就是砭针。
三、原始社会的人工致畸技术
在人体的正常发育过程中，对身体的特定部位，人为的改变人体骨骼的正常形态，或对身体的某些部位施以人为的损伤，这就是人工致畸或人工取形术。这种致畸，一方面是对人体的损伤，一方面也是一种与医疗相关的技术。我国新石器时代的居民约有人工拔牙、头骨枕部畸形和口颊含球致使颌骨变形等三种特殊风俗习惯。人工拔牙风俗分布很广，以山东、苏北一带新石器遗址发现最为普遍。这种风俗最早发现在大汶口文化的早期居民中。据31个个体头骨观察，男性11例中之7例已拔去左上第二齿和右上第二齿，女性20例中之16例已拔左上第二齿和右上第二齿，其拔牙率分别为64%和80%，其年龄在12～13岁以上和青年期。大墩子遗址之拔牙习俗与上述相同，《淮南子·本经训》谓：“逮至尧之时，……尧乃使羿诛凿齿于畴华之野”；《汉书·杨雄传》“凿齿之徒，相与摩牙而争”；《博物志·异俗》记西南少数民族“生儿……即长，皆拔去上齿各一，以为身饰”。我国台湾原住民等新石器时期之墓葬，也发现有拔除左上第二齿和右上第二齿或左上第三齿和右上第三齿的风俗，一直延续到清光绪年间。《新唐书·南蛮传》所述“僚地多瘴（泛指恶性疟疾），中者不能饮药，古自凿齿”。因为恶性疟疾发作多牙关紧闭，不能启齿饮药，预凿齿可以方便给药，有一定的积极作用。
头骨的枕部变形是人为地改变头部形状的一种风俗，在山东苏北大汶口文化中最为普遍，早期的出现率高于晚期，且男女两性中都有。变形的部位主要在后枕部，属于变形头骨中比较简单的枕形。至于这种枕部畸形的确切涵义，还有待进一步研究，或与变态心理的美感有关。
颌骨的异常变形也发现于山东王因和苏北大墩子等大汶口文化遗址，主要是口颊内含一小石球奇特风俗造成的。据大墩子及王因地区出土的口腔含球个体为18具，其中石球15，陶球3，直径15～20毫米，多系女性，其年龄大者40～50岁，最小者仅约6岁。我们今天尚不知其真正的动机，但或许与爱美的某种变态心理有关。
涅齿：是新石时代已出现的以某种染料使牙变黑的一种风俗。《淮南子·修务训》曰：“尧立孝慈仁爱，使民如子弟，西教沃民，东至黑齿”。台湾《风山县志》有：“拔去前齿，齿皆染黑”的记载，云南布郎族也有染齿的习俗。学者有据以制成“氟化双氨银”，防龋取得效果（周大成：《中国口腔医学史考》1991，民卫生出版社24～25页）。
拔牙和头骨的枕部变形等均是原始社会的特殊风俗，若抛开其特定的涵义，其技术和方法与我国外科之发展不无关系。