三叉神经痛是相当常见的一种神经疾病，但是常常被误诊，不是将三叉神经痛误诊为是龋齿痛（待全口牙齿都被拔光后疼痛仍然不止才转诊来神经科诊治者不乏其人），就是将其他疾病（例如鼻咽癌或多发性硬化）误诊为是三叉神经痛。
其实，掌握原发的三叉神经痛的诊断标准并不难：
（1）疼痛的部位符合三叉神经的支配范围：第一枝支配头顶前部、前额及眶部；第二枝支配面颊部；第三枝支配下颌部位，但不包括下颌角在内。凡疼痛波及头顶后部、枕部、下颌角或颈部的都已超出三叉神经范围，不考虑为三叉神经痛；
（2）疼痛呈间歇阵发，在阵发之间有一段不痛的缓解期，缓解时间的长短不一。凡长时间持续、毫无间歇缓解的面部疼痛不是原发的三叉神经痛；
（3）有激发疼痛的“弹机地区”特别是相当于男性长胡须的部位，当病人在洗验、刷牙时触及这些部位就会激发一阵疼痛发作，张口咀嚼或讲话也能激发疼痛的阵发。龋齿引起的疼痛也可为食物或饮水的温度（冷或热）条件所激发，但这种激发方式与三叉神经痛的激发明显不同；
（4）疼痛为单侧性，一次阵发一般不会双侧同时发痛；
（5）疼痛程度十分剧烈。除了在疾病早期由于疼痛阵发时间极短病人尚能忍受外，一般病人都感到痛苦难受，即使要进行开颅手术治疗也心甘情愿。凡病情已有一段时期，而疼痛程度不严重，病人还可以忍受的面部疼痛大多不是三叉神经痛；
（6）客观神经检查正常，未有面部感觉消失或下颌偏斜等破坏性征象。要诊断原发的三叉神经痛以上六项标准缺一不可。
如在主诉疼痛的部位查到有客观感觉减退或消失（经过酒精封闭或手术治疗者除外），或发现张口时下颌偏斜，首先要怀疑到鼻咽癌。如面部疼痛发作外尚有头、面、躯体、肢体方面其他感觉和/或运动症状（尤时好时坏者），则要考虑到多发性硬化症。
大部分原发的三叉神经痛病人在正规服用得理多（卡马西平）后症状能获得改善，少数病人服药无效则可能需要神经外科会诊考虑手术治疗。造成原发的三叉神经痛的原因之一是颅底部位动脉硬化的血管挤压三叉神经节，施行比较简单的血管悬吊术有可能奏效。