康复计划的制定大致包括脑功能测定和康复程序安排两个步骤。
一、脑功能测定
康复计划中脑功能测验的目的，是为了充分揭示受治病人受损伤大脑的哪些功能被破坏，哪些功能是被保留的，以便有的放矢地采取康复措施，合理作出施治的程序安排。
除开对病人的认知能力本身的测定外，还要对病人的情绪状态作出分析评定。据一些研究表明，病人的情绪状态对整个康复过程都产生极大影响。脑功能损伤病人出现的抑郁、对抗和灾难性反应等负性情绪者为数不少，它常常严重地阻碍着康复治疗的进行。因此对这类病例的情绪障碍进行治疗是很必要的。
情绪状态可以通过一些个性调查的方法，如MMPI和临床一些有关情绪的量表来进行评定，来自护人员和家人的资料也是评定情绪的有力依据。
二、康复程序安排
在分析神经病学诊断和测验结果后，还应对与康复有关的病人生活、家庭、社会环境等方面的情况作出分析评定。然后，综合以上诸方面的结果，订出最优化康复程序。所谓最优化，就是使病人能获效最大，但蒙受的负荷（包括心理的、肉体的）尽量减少。例如，病人存在情绪、动机问题，如不首先加以解决，就直接进行技能康复常是徒劳的。另外对那些复杂能力的康复训练，如果没有首先对作为该能力的基本技能加以训练，以此作为基础也是难以奏效的。在优化的程序安排方面，有以下几个原则可供参考。
1．行为、情绪和动机同时有障碍的病人，首先要注意情绪和动机问题的治疗。因为只有病人怀有积极情绪和强烈的治疗动机，才可能对康复训练主动配合，所以，这也是进行机能康复的必要心理准备。
2．脑机能的康复治疗要循序渐进。首先要针对的是病态行为所涉及的那些基本能力障碍的康复训练，如果没有完好的基本能力作为基础，一上手就作复杂行为的训练，一方面难以奏效，更为麻烦的是，这种安排很容易使病人丧失信心，产生畏难情绪。
3．应该将那些认为可能最先和最容易取得疗效的程序，作为先行安排的康复程序。这样的安排有利于建立和巩固病人的治疗信心，容易调动其积极性。
4．不同的功能障碍，对病人有不同的影响，有的功能障碍妨碍病人的日常生活，有的则与病人的职业有关，要根据各人的实际情况和可能性加以安排。