全反式维甲酸诱导前列腺癌细胞系DU-145凋亡的分子机理
西安医科大学学报2000年第21卷第3期
邵晨 邵国兴 王禾 陈宝琦 贺大林 秦荣良 朱峰 赵忠良
摘 要:目的 克隆全反式维甲酸诱导前列腺癌细胞系DU-145细胞产生凋亡的相关基因。探讨维甲酸诱导前列腺癌细胞产生凋亡的分子机理。方法 应用全反式维甲酸诱导前列腺癌细胞系DU-145细胞凋亡,采用基于PCR的改良消减杂交技术克隆与凋亡相关的基因。结果 在前列腺癌DU-145细胞凋亡过程中,有大量肿瘤坏死因子(TNF)的表达,同时,克隆出c-erb b-2基因。结论 TNF及c-erb B-2基因在由全反式维甲酸诱导的前列腺癌细胞系DU-145细胞凋亡过程中起着重要作用。
关键词:肿瘤坏死因子;前列腺癌;凋亡;维甲酸
细胞凋亡(apoptosis)是机体为了维持自身的稳定,所采取的一种积极主动的死亡方式,最初是由Kerr等人于1972年提出的[1]。近年来,人们已经认识到细胞死亡和细胞增殖一样,是一个极其复杂而调控精确的并且有多基因参与的过程[2]。维甲酸是一类与维生素A结构相似的天然或合成物质,临床上最早用于白血病的治疗,近来陆续有报道维甲酸能够诱导多种肿瘤细胞的凋亡,如乳腺癌[3]、肺癌等,而维甲酸同样可以诱导前列腺癌细胞的凋亡,但目前其凋亡的分子机理尚未完全清楚。我们以全反式维甲酸(All trans retinoic acid, ATRA)诱导前列腺癌细胞DU-145凋亡,应用基于PCR的改良消减杂交技术克隆与凋亡相关的基因,以期改进目前克隆基因方法中的不足之处,同时希望进一步明确维甲酸诱导前列腺癌细胞凋亡的分子机理。
1 材料与方法
1.1 细胞系、菌株、载体 前列腺癌细胞系DU-145细胞由美国MD anderson cancer center分子生物学实验室提供,Bluescripe KS, DH5 α由第四军医大学生物化学和分子生物学教研室保存。
1.2 材料 RPMI 1640 (GIBCOBRL), All Trans-Retinvic acid(Sigma),Poly AT tract System-1000 kit (Promega),Klen Taq LA polymerase(CLONTECH),Nucleo Trap Gel Extraction kit(CLONTECH),柱离心式质粒(小量)抽提纯化试剂盒(上海华舜生物工程有限公司)。
1.3 细胞模型的建立 将处于对数生长期的DU-145细胞分为实验组、对照组两组,每组含1×106个细胞,在实验组中加入10μl10-2mol/L ATRA(溶于无水乙醇),使培养液中ATRA终浓度为10-5mol/L,对照组加入10μl无水乙醇,培养液中小牛血清浓度为13%,培养36h,收集细胞。
1.4 实验组及对照组mRNA的提纯 应用Promega Poly aT tract system 1000试剂盒。基本原理是在异硫氰酸胍的作用下裂解细胞,加入biotin标记的oligo-dT来捕获mRNA,用偶联streptavidin的磁珠将mRNA分离出来,具体步骤详见Kit的使用说明。
1.5 制备实验组cDNA 实验组细胞mRNA用SMARTTM pCR cDNA sypthesis kit(clontech)进行反转录,将试剂盒中的3’引物“T30(A/G/C)(A/G/C/T)”替代为3’锚定引物“TACGGCTGCGAGAAGACGACAGAAT30(A/G/C)(A/G/C/T)”,该引物与“can-finder引物前24nt是一样的,其目的在于以后只用一条引物来扩增cDNA。
1.6 制备对照组cDNA 对照组细胞mRNA按常规进行反转录PCR,以T18及10-mer随机引物进行PCR,经多次实验确立的PCR条件为:20μmol/L biotin-21-dUTP(clontech),200μmol/L dNTP,1μg oligo-dT(15~18),90pmol 10聚随机引物1μl,1μl反转录模板,50μl反应体积;PCR参数为:95℃,20s;40℃,5min;72℃,3min;循环40次。扩增产物作为杂交探针,也称为驱动DNA。
1.7 杂交 将3μl实验组cDNA与100μl杂交探针进行杂交,条件为6×SSC,0.5% sDS,65℃杂交16h。
1.8 差异cDNA模板的获得 用下列方法除去杂交体及驱动cDNA,将杂交液加到Sephacryl s-400 spin column(Promega),离心收集液体。将上述液体加到0.1ml streptavidin magnesphere@ paramagnetic particles(Promega)(将1ml磁珠悬液用0.5×SSC洗涤3次,再悬于0.1ml0.1×SSC)中,室温结合2min,65℃温育5min减少非特异性杂交,在磁场作用下分离出上清作为PCR模板。
1.9 差异cDNA模板的扩增及差异片段的获得 由于差异cDNA模板在反转录时其两端已偶联上引物序列,因此可直接用PCR将其扩增出来。为了保持cDNA片段的长度,PCR用Advantage cDNA PCR kit(clontech LD-PCR),条件为:200μmol/L dNTP,400nmol/L 引物(TACGGCTGCGAGAAGACGACAGAA,与5′的帽子引物和3’的锚定引物对应);40μl杂交分离后的上清作为模板,5μl反应体积,PCR参数为95℃15s,68℃ 5min,循环25次。
1.10 差异片段的克隆 ①将PCR产物沉淀,重新溶解于20μl h2O中,加入PCR Buffer, 100mmol/L dATP 1μl, Taq酶4μl于72℃,反应1h,此后进行1.5% agarose电泳分离,用核酸胶回收试剂盒(Nucleo Trap Gel Extraction kit clontech)回收0.6~1.5kb的片段。②用EcoR V酶切Bluescript ks进行类似上述反应,将dATP换为dTTP制备T vector。③用常规方法进行连接、转化,并挑选白色克隆,摇菌。
1.11 质粒的提取及鉴定 应用柱离心式质粒(小量)抽提纯化试剂盒提取质粒,用EcoR i及Hind Ⅲ进行插段鉴定,选取有插段的质粒。
1.12 反向点杂交鉴定 以对照组cDNA为模板,以10-mer随机引物及T18为引物,加入含32P-dATP的dNTP,用PCR方法制备探针。反向点杂交方法鉴定有插段的质粒,选取阳性克隆,杂交时设立阴性、阳性对照。
1.13 测序 纯化所选取的克隆,按说明进行测序反应,测定序列,正向测序完成后,进行Blast比较。
1.14 计算机序列分析 使用计算机软件PC/GENE6.60版,并通过国际互联网(internet)利用NCBI Genbank和SWLSS-PROT proDom数据库对所测得的基因进行:核酸及蛋白质序列同源性分析(BLAST),基因片段的编码区分析,局部组成复杂性(Local composition complexity,LCC)分析等。
2 结果
2.1 消减杂交前后PCR产物的鉴定及PCR回收产物的电泳鉴定结果 在实验中,分别对实验组、对照组的cDNA模板以及对杂交后cDNA模板进行PCR,区域性回收杂交后cDNA模板的PCR产物,并对上述产物进行电泳鉴定(图1)。
图1 PCR产物电泳鉴定图
1~4道分别为杂交后cDNA,实验组原始cDNA,对照组原始cDNA,回收杂交后cDNA模板的PCR产物,5道为PCR Marker
2.2 含有差异cDNA插段克隆的鉴定结果 选取鉴定大小在0.6~1.5kb插段的克隆,较长片段的鉴定准备后续完成。随机挑选16个白色克隆,鉴定出其中10个含有插段,图2为部分克隆的酶切鉴定图(EcoR i和Hind Ⅲ双酶切)。
图2 部分克隆的酶切鉴定图
a为DNA marker, B-J为随机挑选的白色克隆,H道为3号克隆
2.3 反向点杂交结果 将10个含有插段的克隆点膜,进行反向杂交,探针为对照组的PCR产物,杂交后放射自显影,共有4个杂交阳性信号,予以剔除。
2.4 序列测定及BLAST初步分析结果 将6个克隆以正向引物为测序引物,测序后进行计算机分析,其中3号为c-erb b-2基因,6号克隆有可能为新基因,6号克隆的测序工作尚在进行中。而1、2、4、5号克隆结果均为TNF,克隆1,2,3,4,5的核酸序列分析(BLAST)见表1。
表1 克隆序列的BLAST分析
克隆序号 |
片段大小(bp) |
BLAST结果 |
1 |
800 |
Synthetic human tumor necrosis factor mRNA |
789 |
2 |
900 |
Human mRNA for necrosis factor |
805 |
3 |
1000 |
Human c-erb B-2 mRNA |
761 |
4 |
800 |
sapiens tumor necrosis factor alpha |
775 |
5 |
1000 |
Synthetic human tumor necrosis factor mRNA |
731 |
3 讨论3.1 维甲酸对前列腺癌细胞生长的影响 维甲酸是一类与维生素A结构相似的天然或合成物质,最早临床用于白血病的治疗,并认为其具有调控生物细胞增殖、分化的作用。近年来,人们发现其对前列腺癌细胞的生长也有影响,这种影响表现为双向性的,Chan-Jye fong[4]等以ATRA作用于前列腺癌细胞LNCaP,当浓度为10μmol/L时,细胞生长明显受抑制并出现凋亡,而作用浓度降至0.1μmol/L则促进细胞生长,这种作用和维甲酸的作用浓度关系密切。同时,维甲酸对抗表皮生长因子EGF以及TGF-α对前列腺癌细胞的促生长作用,加强TGF-β对前列腺癌细胞生长的抑制作用,并且与去氢睾酮共同影响前列腺癌细胞分泌PSA的能力。而维甲酸受体已证实为类固醇/甲状腺激素样受体家族成员之一[5],并且它与雌激素对前列腺癌细胞的作用有类似之处[6]。同时维甲酸可以使前列腺癌细胞的细胞核受体基因hRXR-alpha的表达升高,并使细胞代谢发生改变[7]。Esquenet[8]等也发现,前列腺癌的生长与分化,不但受雄激素与生物因子的调控,RA及VC等也参与调控。体外高浓度的维甲酸可以导致前列腺癌细胞凋亡已被广泛实验证实,但对于维甲酸在人体内对前列腺癌的影响尚存争议。我们曾应用ATRA(10-5mol/L)作用DU-145细胞48h,发现细胞形态改变明显,伪足消失,细胞变圆,胞内颗粒增多,流式细胞仪出现凋亡峰(5%),考虑到基因水平的改变往往应在细胞发生变化之前,因此选择在形态改变尚不显著的作用36h。此为一个折中的选择,但未必是最佳的时间点。
3.2 肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor, TNF)及c-erb B-2基因与凋亡的关系 在实验中,我们通过随机挑选产生并经鉴定和测序的6个克隆中,其中4个测序结果证实为TNF基因。TNF是一类配体的超家族,目前该家族成员包括TNF,LT-α、Fas ligand CD40L,CD27L,CD30L等,TNF诱导凋亡是通过Caspase激活而引发细胞凋亡的,同时,大多数细胞表面有TNF-R,TNF与TNF-R结合也是TNF诱导凋亡的主要方式[9]。通过免疫组化发现[10]在正常前列腺基底细胞中有TNF受体相关基因TRAF-4的表达,而腺上皮细胞没有TRAF-4的表达。Roklin等[11]进一步通过实验证实,与其它前列腺癌细胞不同,DU-145细胞不但存在死亡受体(Fas)的跨膜及死亡结构域的表达,而且表达TNF家族成员CD40。本实验在维甲酸诱导DU-145细胞凋亡过程中,克隆出大量TNF家族基因,也从一方面证实了TNF在前列腺癌细胞凋亡过程中起着很重要的作用。我们知道,bcl-2作为抗凋亡基因之一,与肿瘤细胞的凋亡关系密切,国际乳腺癌研究小组Natha[12]等人通过对107名乳腺癌患者的研究发现,患者的肿瘤细胞中,c-erb b-2基因与bcl-2基因的表达呈负相关(P=0.002),这高度提示c-erb B-2基因可能存在促进肿瘤细胞凋亡的作用。1999年He q[13]等人也发现c-erb B-2基因表达的高低和凋亡指数(AI)的大小与结肠直肠癌患者的血管淋巴转移能力有关,而本实验也首次发现在前列腺癌细胞凋亡过程中,c-erb b-2基因可能起一定作用,这也从另一方面证实C-erb B-2基因与凋亡关系密切。
3.3 关于克隆基因方法的改进 我们知道,传统的DD-PCR技术工作量很大,得到的片段较小,而且片段在编码区内的几率小,同时假阳性率高,最高可达80%,因而工作效率低,而消减杂交技术同样步骤烦琐,工作量大,假阳性率高,而且对于低丰度的基因不能进行有效克隆[14]。本实验所采用的基于PCR的消减杂交方法是建立在Cap-finder技术,LD-PCR biotion-dNTP,磁性分离系统及Sephacryl离心柱分离技术等多种新技术手段之上,在很大程度上解决了上述问题,它简化了实验步骤,减少了假阳性率的发生,对低丰度基因的克隆效果有很大提高,而且得到的序列多在编码区内。这种新方法为克隆新基因提供了一个有意义的尝试。
邵晨(第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032)
邵国兴(第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032)
王禾(第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032)
陈宝琦(第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032)
贺大林(西安交通大学第一医院泌尿外科)
秦荣良(第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032)
朱峰(西安交通大学第一医院泌尿外科)
赵忠良(第四军医大学生物化学及分子生物学教研室)
参考文献:
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