微生物是无所不在的物种，布满在自然界、动植物及人体，不过因其极为微小，看不见，摸不着，因此必须用显微镜观察才证实其存在。人体正常微生物与生俱来，伴随终生。微生物虽然微小，但数量庞大，一个人排出的粪便中，微生物约占干粪重量的40%左右，人从出生后就生活在有菌环境中，因此，皮肤以及与外界相通的腔道，如口腔、鼻咽腔、肠道、泌尿生殖道均存在大量各类微生物寄居，成为人体不可缺少的一部分。寄居在人体的正常微生物丛一般情况下，对人体无害反有益，当然，在特定条件下也可致病。
人体正常微生物丛对人体的有益作用是多方面的，有的微生物能在皮肤或粘膜表面形成一层菌膜屏障，防止外来致病菌的入侵，并能产生一些抗菌物质，抑制甚至杀死入侵的致病菌；有的微生物能产生一些人类需要的营养物质，如维生素B复合体的和维生素K、锌、硒、铁、铜等物质和微量元素；有的能帮助蛋白质、脂类和胆固醇的代谢；有的还能防止体内致癌物质的产生，起到防癌作用，还有重要的是正常微生物能够增强人体免疫力。
由于正常微生物的刺激，人体血液和分泌中产生自然抗体和免疫细胞，其免疫功能重要的是抗感染和抗肿瘤两方面。自然抗体和免疫细胞能够抑制致病微生物生长，增强白细胞吞噬细菌的能力，在抵抗感染上起重要作用，实验证明，无菌动物的淋巴系统衰退，淋巴结缩小，有免疫功能的细胞减少，抗体产生能力降低，此种动物非常容易发生感染。正常微生物丛中有的细菌有免疫赋活作用，激活巨噬细胞增强吞噬能力，并刺激免疫细胞产生免疫物质淋巴因子，提高抗肿瘤活性。日本学者证明从正常人分离得到的双歧杆菌，不论活菌或死菌均有抑癌作用，并将此菌制成药剂试用于肿瘤治疗，给肿瘤患者带来新的希望。