人体有抗御微生物感染的能力，其能力强弱除与人的年龄、营养状况及一般情况外，更重要的是人体的免疫功能。抗感染免疫功能是人体原有的非特异性免疫力和随这些病原微生物刺激后产生的特异性免疫力，可以表现出：无症状；一定时期的带菌者；或者有轻重不等的临床症状，即成为患者。当人体免疫力强时可不发生疾病，免疫力低时才患病，人体一经感染，不论患病与否，都会由于病原微生物刺激而产生免疫力，只是根据病原微生物这些抗原性质的不同，刺激机体产生的免疫力强弱及持续时间的久暂有所不同。人体内非特异性免疫（原存于体内，生来就有）和特异性免疫（由病原微生物等刺激机体才产生）、细胞免疫和体液免疫相辅相成，相互影响，共同发挥抗感染作用。
人体抵抗各种病原微生物的方式不尽相同。抵抗引起脓疡的葡萄球菌或引起肺炎的肺炎球菌等主要靠其产生的相应抗体协助体力中性粒细胞将细菌吞噬消化；抵抗引起白喉的白喉杆菌毒素或引起破伤风的毒素，则机体由这些毒素刺激而产生的抗体（抗毒素）可将毒素中和破坏。病素（如麻疹病毒、流行性感冒病毒、甲型和乙型等肝类病毒、脊髓灰质炎病毒等）从不同途径进入体内后，要侵犯一定的细胞才能增殖，并发挥致病作用，对付这些病毒，则机体首先利用抗体限制病毒随体液扩散，再产生细胞因子等免疫分子与病毒感染细胞发生免疫反应，在破坏细胞的同时消毁了侵入细胞内的病毒，使机体康复。人体在感染过程中产生的免疫力可抵抗这种病原微生物的再次感染。